Izveidojušās peldošas ūdensaugu salas jeb slīķšņu salas bija aizsprostojušas caurteci tādējādi veicinot Limbažu Dūņezera turpmāku aizaugšanu. Lai samazinātu ūdensaugu aizaugumu, Limbažu novada pašvaldība sadarbībā ar pašvaldības aģentūru “ALDA” iesniedza pieteikumu Latvijas Vides aizsardzības fonda projektu konkursa aktivitātes “Dabas un bioloģiskās daudzveidības saglabāšana un aizsardzība” apakšaktivitātē 2.1 “Sugu dzīvotņu un biotopu apsaimniekošanas pasākumi īpaši aizsargājamās dabas teritorijās”.
Iesniegtais projekta pieteikums guva atbalstu un šīs problēmas risināšanai pašvaldība saņēma Latvijas Vides aizsardzības fonda finansējumu 29 969,00 EUR apmērā. Kopējās projekta izmaksas plānotas 33 299,69 EUR, no tām 3330,69 EUR līdzfinansē Limbažu novada pašvaldība.
Ūdensaugu aizauguma samazināšanas ietvaros 8430,3 m2 platībā veikta virsūdens augāja pļaušana, sakņu sistēmas smalcināšana un šobrīd vēl tiek veikti pēdējie darbi attiecībā uz peldošo slīkšņu salu nostiprināšanu, lai tās nenosprostotu attīrīto Dūņezera daļu un brīvu noteci.
Ūdensaugu aizauguma samazināšana Limbažu Dūņezerā veikta saskaņā ar Valsts vides dienesta izsniegtajiem tehniskajiem noteikumiem un ņemot vērā Dabas aizsardzības plānā noteiktos sugu dzīvotņu un biotopu apsaimniekošanas pasākumus.
Iepirkumu konkursa rezultātā ūdensaugu aizauguma samazināšanas pasākumus veica SIA ,,SB Transbulk”. Limbažu novada pašvaldības aģentūras “ALDA” direktors Jānis Remess veic projekta vadītāja pienākumus.